有很多财务小伙伴很疑惑：总公司可以给分公司开发票吗？分公司发票能在总公司抵扣吗？如果可以的话，是不是就是三流不一致了，会不会涉嫌虚开发票呢？别急！小编带大家一个一个的搞清楚、搞明白！

首先，什么是三流一致？

“三流一致”：销售方、开票方和收款方为同一主体；购买方、受票方和付款方为同一主体，达到三流一致。

看下图更为直观：

       

很多人之所以问三流不一致是否有涉税风险，其中一个重要的原因就是认为如果三流不一致，会被税务机关定性为虚开发票的风险！

三流不一致(包括总分机构）

一定是虚假业务虚开发票吗？

先看个例子：

甲公司销售A商品给乙公司，甲公司给乙公司发货并开票；丙公司欠乙公司货款，经协商一致，实际上，丙公司直接代替乙公司，向甲公司付款；以上交易中，甲开票给了乙，但是实际上货款是丙公司支付的，这种情况是否合法合规？

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猫叔解析：实务中，应该不少企业会遇到这种情况，企业之间的应收应付款项相互抵消，这种情况往往会涉及到三方资金结算，受票单位、付款单位并不一致（受票单位为乙公司、付款单位为丙公司），如果想要合理化，避免一些不需要的纠纷、争议以及税收风险，就需要提供能够证明代付合理性的证据，比如签订三方协议，说明代付理由；付款备注支付原因等。

会计分录如下

1、甲公司销售商品给乙公司并开票的会计分录

借：银行存款

贷：主营业务收入——A商品

      应交税费——应交增值税（销项税额）

2、乙公司收到商品的会计分录

借：库存商品——A商品

     应交税费——应交增值税（进项税额）

贷：应收账款——丙公司

3、丙公司代乙公司支付货款的会计分录

借：应付账款——乙公司

贷：银行存款

注：《中华人民共和国增值税暂行条例》第八条规定，纳税人购进货物、劳务、服务、无形资产、不动产支付或者负担的增值税额，为进项税额。也就是说，“支付或者负担”乃是可以抵扣进项税额的必要条件。

如上所述，由乙公司直接支付，货款是由乙公司实际负担的，因此“代付款”并未违反此规定，而不因此影响抵扣，不属于“虚开发票”情形。

总公司签合同，分公司执行，

发票到底由谁来开？

实务中，很多是总公司出面去谈业务签合同，实际上由分公司执行的，分公司能不能开票给对方呢？实际上，就增值税而言，总分机构是独立的纳税单位，如果分公司想开票，就要有相应的合同以及交易事项协议等作为支撑依据。

目前对于内部授权分公司直接开票的，只有建安行业有政策（国家税务总局公告2017年第11号《国家税务总局关于进一步明确营改增有关征管问题的公告》）。所以分公司开具发票，总公司与分公司需要与客户签订三方协议，为了尽量规避风险，最好约定分公司作为收款方。

总公司能否为分公司开具增值税发票？

是否有税务风险？

如果总分公司之间确实存在正常的、真实的经济业务往来，发生了应税货物、服务或劳务，属于增值税应税范围的,“亲兄弟明算账”，如实开票即可，保存相关的合同、凭据等资料备查即可。

举个例子：

一般纳税人A公司有一分公司B，2021年10月份，A公司向分公司提供一项服务，总公司A能否开发票给分公司B呢？

答案:

对于真实的属于增值税纳税范畴的经济业务，总公司可以给分公司如实开票。

(1)增值税方面

总公司与分公司都是独立的纳税单位，如果总分公司之间收取的是服务费，按照现代服务业缴纳增值税，税率是6%，征收率是3%或者1%。

分公司的增值税一般情况下是就地申报纳税，分公司如果发生了应税行为，可自行开票，抵扣，申报纳税。

政策依据：

1.《中华人民共和国增值税暂行条例实施细则》第四条规定：“设有两个以上机构并实行统一核算的纳税人，将货物从一个机构移送其他机构用于销售的，视同销售货物，但相关机构设在同一县（市）的除外。” 

2.《中华人民共和国增值税暂行条例》第二十二条规定，固定业户应当向其机构所在地的主管税务机关申报纳税。总机构和分支机构不在同一县（市）的，应当分别向各自所在地的主管税务机关申报纳税。因此，分支机构的增值税一般情况下就地申报纳税。也有比较特殊的情况，需要汇总缴纳增值税，不过由于这种情况需要满足财税[2013]74号的相关规定，需要经过财政部和国家税务总局批准，比如我国铁路和航空运输企业、中石油、中石化等，它们就是财税专门发文规范了的。

(2)企业所得税方面

总分机构之间相互提供服务的，是不需要缴纳企业所得税。那有人问了？难道分公司本身不需要缴纳企业所得税吗？

这里说明一下：由于分公司是没有法人资格的，所以正常情况下，分公司无需独立申报企业所得税！

所以，除非另有规定，分公司都不需要独立汇算清缴企业所得税，而是就地分摊缴纳企业所得税。年度汇算时，总公司来汇总企业年度应纳税所得额，扣除掉总机构和分支机构的预缴税款，多退少补。

(3）账务处理

①总公司

借：内部往来——分公司往来

贷：其他业务收入

      应交税费——应交增值税（销项税）

②独立核算的分公司

借：其他业务成本

       应交税费——应交增值税（进项税）

贷：内部往来——分公司往来

总分公司常见的发票问题

分公司抬头的成本费用发票，可以拿到总公司税前扣除和抵扣吗？

答复：分公司和总公司在增值税上属于不同的纳税主体，二者纳税人识别号也不一样，因此分公司接受的专票不可以放到总公司抵扣，各自抵扣自己的。

若是总分公司的企业所得税是汇总纳税的，而企业所得税是法人税制，总公司的发票开成分公司的抬头是可以在企业所得税中扣除的。

分公司和子公司

你能区分清楚吗？

子公司是想对于母公司而言的，母公司和子公司都享有独立法人地位，都是公司，独立承担民事责任。只不过母公司是子公司的投资方（或者说控股股东），二者之间是投资关系。在集团公司中，母公司、子公司的概念使用的较多。

而分公司是没有法人资格的，属于公司的分支机构，且分公司不能独立承担民事责任！这就是他们之间主要的不同。

来源：猫叔说税